Родился в 1946 в городе Аза (департамент Верхняя Гаронна). Закончил Высшую школу изящных искусств в Париже (1970) и Гарвардский университет (1973).
Затем Вигье основал в Париже совместно с Жаном-Франсуа Жодри (Jean-François Jodry) архитектурную мастерскую, которая просуществовала до 1992. Тогда он открыл собственное бюро Jean-Paul Viguier SA d'architecture, которым руководит до сих пор.
Среди ключевых построек Вигье - павильон Франции на международной выставке Экспо-1992 в Севилье, штаб-квартира France Télévisions в Париже (1998), археологический музей и реконструкция пространства вокруг римского акведука Пон-дю-Гар близ Нима (2000), парк Андре-Ситроен в Париже (2000, в соавторстве), небоскребы Кёр-Дефанс в районе Дефанс (2001) и Sofitel Chicago Water Tower в Чикаго (2002), реконструкция музея естественной истории в Тулузе (2008) и музея искусств МакНей в Сан-Антонио (2008).