Арата Исодзаки родился в 1931 в городе Оита на юге Японии в семье крупного предпринимателя, увлекавшегося также написанием хайку. Учился, как и большинство передовых японских архитекторов второй половины XX века, у Кэндзо Тангэ в Токийском университете, участвовал в его проектах, например, в разработке плана для Токио 1960 года и для Скопье 1965-го. Несмотря на то, что именно в этой среде сложился круг метаболистов (Кисё Курокава, Киёнори Кикутаки, Фумихико Маки и другие), Исодзаки испытал влияние их идей, но не более того, наряду, например, с использовавшимися им тогда принципами брутализма. Это отразилось в принесшей ему славу библиотеке префектуры Оита в родном городе. Параллельно он занимался экспериментальными проектами, например, еще более близким к метаболизму «Городом в небе»; для Миланской триеннале-1968 он подготовил инсталляцию «Заново разрушенная Хиросима» («Разрушение будущего города») в «Электрическом лабиринте», основанную на изображении руин Хиросимы и погибшую в ходе студенческих волнений того года.